WWW.KONF.X-PDF.RU
БЕСПЛАТНАЯ ЭЛЕКТРОННАЯ БИБЛИОТЕКА - Авторефераты, диссертации, конференции
 


Pages:     | 1 || 3 |

«БАКТЕРИИ-ДЕСТРУКТОРЫ ФЕНОЛА И ЕГО ХЛОРИРОВАННЫХ ПРОИЗВОДНЫХ ...»

-- [ Страница 2 ] --

3.2. Дот-блот гибридизация препаратов геномных ДНК штаммов деструкторов и плазмиды pJP4 Cupriavidus necator JMP134 На примере плазмиды pJP4 штамма Cupriavidus necator JMP134 Fukumori F. и Hausinger R. установили, что, несмотря на то, что наличие кластера tfdгенов не определяет способность к деструкции 2,4,5-Т, фермент tfdA, кодируемый геном tfdA плазмиды pJP4, способен катализировать конверсию 2,4,5-Т до 2,4,5-трихлорфенола (Fukumori F., Hausinger R.P., 1993).

Известно, что плазмида pJP4 штамма Cupriavidus necator JMP134 имеет в своем составе два гомологичных, но не идентичных генных кластера – tfdCIDIEIFI (tfdI-кластер) и tfdDIICIIEIIFII (tfdII-кластер) (Laemmli C.M. et al., 2000;

Itoh K. et al., 2002; Ledger T. et al., 2006).

С учетом приведенных выше данных был проведен поиск гомологов кластера генов tfdA-F плазмиды pJP4 в геномах исследуемых штаммов.

На рисунке 7 представлены результаты дот-блот гибридизации препаратов геномных ДНК вновь выделенных штаммов с 32P - меченым препаратом плазмиды pJP4.

К А Б В Рисунок 7 – Результаты дот-блот гибридизации препаратов геномных ДНК штаммов с препаратом 32P ДНК плазмиды pJP4.

Условные обозначения: К-контроль – препарат ДНК Cupriavidus necator JMP134; А, Б, В – препараты ДНК штаммов A. globiformis 17S (1), B. cereus 33T (2), B. subtilis 16 (3), Citrobacter sp. 36 4CPA (4), G. oxydans 2T (5), P. fluorescens 39D (6), P. kilonensis 34T (7), R. planticola 33 4CPA (8), Stenotrophomonas sp.

33T(9) и Xanthomonas sp. 33DCP (10).

Принимая во внимание то, что такой же результат был обнаружен для препаратов ДНК штаммов A. xyloxidans 33P, Agromyces sp. 34DCP, A.

tumefaciens 21SG, A. irakense 38D, B. salcis 38P, E. asburia 33D, E. cloacae 34 4CPA, P. agglomerans 36P, P. aeruginosa 36DCP, P. putida 19S, R. rubropertinctus 5D, R. planticola 36D, R. planticola 36T и S. marcescens 22S, становится очевидным факт отсутствия в геномах вновь выделенных бактерий последовательностей, гомологичных модельной плазмиде pJP4.

Следует принять во внимание то, что ранее Smejkal С. с коллегами предпринимали попытку, оказавшуюся безуспешной, амплифицировать консервативные tfd-гены среди членов консорциума с представителями рода Stenotrophomonas, способного деградировать гербициды 4-(2,4дихлорфенокси)бутиловую кислоту (2,4-DB) и 4-(4-хлор-2метилфенокси)бутановую кислоту (MCPB) (Smejkal C.W. et al., 2003).

Наблюдения Smejkal С. и соавторов согласуются с полученными в данной работе результатами сравнительного анализа генетических структур вновь выделенного Stenotrophomonas sp. 33Т.

Таким образом, на основе результатов ПЦР-анализа проведенный с использованием геноспецифических олигонуклеотидных праймеров и ДНКДНК гибридизации можно сделать заключение о том, что в геномах исследуемых штаммов отсутствуют кластеры, гомологичные последовательностям tftA и tfdA, кодирующим субъединицу 2,4,5-Т-оксигеназы и 2,4-Д/-кетоглутарат диоксигеназу.

Приведенные данные делают очевидным то, что генетические системы, детерминирующие процессы деструкции 2,4,5-Т у изучаемых штаммовдеструкторов, являются оригинальными.

Следует отметить, что результаты исследований генетических особенностей вновь выделенных штаммов хорошо согласуются со сведениями об особенностях метаболизма хлорированных ароматических производных, которые были описаны выше в данной работе для A. xyloxidans 33P, A.

tumefaciens 21SG, Agromyces sp. 34DCP, A. globiformis 17S, A. irakense 38D, B.

cereus 33T, B. subtilis 16, B. salcis 38P, Citrobacter sp. 36 4CPA, E. asburia 33D, E.

cloacae 34 4CPA, G. oxydans 2T, P. agglomerans 36P, P. aeruginosa 36DCP, P.

fluorescens 39D, P. kilonensis 34T, P. putida 19S, R. planticola 33 4CPA, R.

planticola 36D, R. planticola 36T, R. rubropertinctus 5D, S. marcescens 22S, Stenotrophomonas sp. 33T и Xanthomonas sp. 33DCP, указывающими на то, что изучаемые штаммы выполняют оригинальные каталитические реакции конверсии моноароматических галогенидов.

Приведенный выше анализ детерминант деструкции хлорированных ароматических кислот, свидетельствует в пользу того, что генетические системы контроля катаболизма хлорированных ароматических соединений у вновь обнаруженных штаммов родов Achromobacter, Agrobacterium, Agromyces, Arthrobacter, Azospirillum, Bacillus, Brenneria, Citrobacter, Enterobacter, Gluconobacter, Pantoea, Pseudomonas, Raoultella, Rhodococcus, Serratia, Stenotrophomonas и Xanthomonas отличаются от известных и обнаружены впервые.

4. Структурно-функциональные особенности плазмид штаммовдеструкторов

4.1 Сравнительный анализ плазмид деструкторов Ранее было показано, что генетические системы катаболизма синтетических соединений, множественной устойчивости к антибиотикам, устойчивости к тяжелым металлам могут располагаться на плазмидах (El-Deeb A.B., 2001; Ledger T. et al., 2006; Ye J. et al., 2010). Плазмиды обеспечивают подвижность экологически важных групп генов как внутри клетки (между хромосомой и плазмидой), так и между разными видами через механизмы горизонтального переноса.

Одним из наиболее изученных примеров плазмид, несущих кластеры генов катаболизма ксенобиотиков, является плазмида pJP4 штамма Cupriavidus necator JMP134 (Trefault N. et al., 2004).

Анализ плазмидного статуса вновь выделенных культур показал, что штаммы-деструкторы Citrobacter sp. 36 4CPA, R. planticola 33 4CPA, R.

planticola 36D, R. planticola 36Т, S. marcescens 22S, Stenotrophomonas sp. 33Т, P. kilonensis 34Т и Xanthomonas sp. 33DCP обладают плазмидами На рисунке 8 приведены результаты фракционирования плазмидной ДНК штаммов Stenotrophomonas sp. 33Т, P. kilonensis 34Т и Xanthomonas sp. 33DCP.

–  –  –

По результатам электрофоретического анализа было сделано заключение о том, что клетки штаммов Stenotrophomonas sp. 33Т, P. kilonensis 34Т и Xanthomonas sp. 33DCP несут плазмиды, которые были обозначены как pST33T, pPK34T и pXS33, соответственно.

С помощью ПДРФ-анализа было установлено, что размер плазмид pST33T Stenotrophomonas sp. и pPK34T P. kilonensis 34Т 33Т составляет около 27 т.п.н., а плазмиды pXS33 Xanthomonas sp. 33DCP – около 46 т.п.н.

В клетках R. planticola 33 4 CPA, R. planticola 36D и R. planticola 36Т были обнаружены плазмиды, обозначенные как pRP33 4CPA, pRP36D и pRP36Т, соответственно (рис. 9).

–  –  –

Рисунок 9 – Результаты электрофоретического фракционирования BamHIфрагментов (A), HindIII-фрагментов (B) и PstI-фрагментов (C) препаратов плазмид pRP33 4CPA, pRP36D и pRP36T.

Рамками показана область рестрикционного полиморфизма плазмид.

Проведенный RFLP-анализ показал, что все три плазмиды имеют BamHI-, HindIII- и PstI-сайты рестрикции, при этом у плазмид pRP33 4CPA и pRP36Т обнаруживались идентичные профили фрагментов ДНК, в то время как в структуре pRP36D имелись существенные отличия (рис. 9).

На основании полученных данных были определены размеры плазмид:

pRP33 4CPA и pRP36Т – около 110 т.п.н., а плазмиды pRP36D – около 127 т.п.н.

Клетки Citrobacter sp. 36 4CPA и S. marcescens 22S несли плазмиды рАН 36 4CPA и pSM 22S, размеры которых составляли 5,2 т.п.н. и 48 т.п.н., соответственно.

С целью локализации кластеров генов, детерминирующих деградацию хлорфеноксикислот, был использован метод элиминации плазмид, индуцированной обработкой клеток микроорганизмов ДНК – тропными агентами. В ходе сравнительных исследований было установлено, что с потерей плазмид клетки Citrobacter sp. 36 4CPA, R. planticola 33 4CPA, R. planticola 36D, R. planticola 36Т, S. marcescens 22S, Stenotrophomonas sp. 33Т, P.

kilonensis 34Т и Xanthomonas sp. 33DCP утрачивали способность использовать 4-ХФУК, 2,4-Д и 2,4,5-Т в качестве единственного источника углерода и энергии.

Эти данные свидетельствуют о том, что детерминанты, контролирующие катаболизм хлорфеноксиуксусных кислот Citrobacter sp. 36 4CPA, P. kilonensis 34Т, S. marcescens 22S, Stenotrophomonas sp. 33Т и Xanthomonas sp. 33DCP, располагаются на плазмидах.

На основе полученных характеристик плазмиды рАН 36 4CPA, pSM 22S, pRP33 4CPA, pRP36D, pRP36Т, pST33T, pPK34T и pXS33 классифицированы как новые D-плазмиды бактерий.

4.2. Горизонтальный перенос плазмид и экспрессия функций катаболизма хлорфеноксикислот в других бактериальных хозяевах Результаты изучения способности плазмид pRP33 4CPA, pRP36D и pRP36Т к трансферу и экспрессии катаболических функций в различных хозяевах приведены таблице 3.

Из данных таблицы 3 следует, что конъюгативный перенос плазмид pRP33 4CPA и pRP36D в клетки родственного штамма R. planticola 36Т в модельной системе показал, что все трансконъюганты экспрессировали генотипы, соответствующие донорским плазмидам.

Сходный результат был получен и с использованием плазмид pRP33 4CPA, pRP36D, pRP36T для штамма G. oxydans 2T.

В тоже время переход плазмид pRP33 4CPA, pRP36D, pRP36T в клетки штаммов Citrobacter sp. 36 4CPA и S. marcescens 22S не наблюдался.

Обнаруженные данные свидетельствовали в пользу возможности трансфера катаболических плазмид pRP33 4CPA, pRP36D и pRP36T в клетки других штаммов путем конъюгации.

Следует отметить, что экспрессия катаболических генов деградации хлорфеноксиуксусных кислот и функций устойчивости к антибиотикам и солям тяжелых металлов в новом хозяине осуществлялась в полном объеме.

Таблица 3 – Результаты анализа конъюгативного переноса плазмид RP33 4CPA, pRP36D и pRP36Т в условиях чистой культуры

–  –  –

Условные обозначения детерминант устойчивости:

- к антибиотикам: tet+ – к тетрациклину; cat+ – хлорамфениколу; kan+ – канамицину; bio+ - биомицину; к ионам тяжелых металлов: cob+ – к Co2+; cad+ – Cd2+; arg+ – Ag+.

В ходе работы была также проверена возможность передачи обнаруженных плазмид путем трансформации.

Из данных, приведенных в таблице 4, видно, что трансформированные клетки штамма E.coli HB 101 с приобретением плазмид рАН 36 4CPA и pSM22S приобретали способность к конверсии селективных ксенобиотиков, а именно, 2,4-Д и 2,4,5-Т.

Из данных табл. 4, также следует, что клетки штамма R. planticola 33 4CPA с приобретением плазмиды рАН 36 4CPA приобретали способность к конверсии 2,4-Д и 2,4,5-Т.

Таблица 4 – Результаты тестирования катаболической активности штаммов при трансформации рАН 36 4CPA и pSM22S

–  –  –

Условные обозначения: (+) - наличие роста, (–) - отсутствие роста Обретение способности использовать хлорфеноксиуксусные кислоты в качестве единственного источника углерода и энергии означает, что свойство деструкции ксенобиотиков может быть реализовано в различных бактериальных хозяевах в случаях трансфера плазмид.

Полученные результаты указывают на возможность передачи среди бактериальных членов популяций генетических кластеров, контролирующих реакции катаболизма хлорфеноксиуксусных кислот, расположенных на плазмидах рАН 36 4CPA Citrobacter sp. 36 4CPA и pSM22S S. marcescens 22S (путем трансформации) и на плазмидах pRP33 4CPA, pRP36D и pRP36T штаммов R. planticola (путем конъюгации).

5. Результаты изучения возможности практического применения штаммов- деструкторов Результаты исследований, приведенные выше, указывают на целесообразность практического применения вновь выделенных штаммов, в частности, для очистки объектов, загрязненных фенолом и его галогенсодержащими производными, а также для создания in vitro новых штаммов, способных изменять свойства молекул хлорфеноксикислот в сторону их детоксикации и снижения устойчивости в окружающей среде.

5.1. Использование штаммов-деструкторов для ремедиации окружающей среды Перспективы использования штаммов-деструкторов в целях улучшения качества очистки промышленных стоков от фенолов были определены в ходе исследований, направленных на снижение содержания фенолов в стоках предприятий нефтехимического профиля.

В результате испытаний штаммов в условиях реальных сточных вод, характерных для нефтехимического производства Северного промышленного узла РБ, было обнаружено, что культуры A. globiformis 17S, B. cereus 34T, B.

subtilis 16, G. oxydans 2T и S. marcescens 22S способны эффективно снижать концентрацию фенола и его производных в условиях загрязненной водной среды и почвы.

Культура A. globiformis 17S проявила активность в условиях комплекса загрязнений сточных вод производства дубильных экстрактов ОАО «Дубитель»

и ОАО «Ново-Уфимский НПЗ» (табл. 5).

Таблица 5 – Результаты анализа содержания фенолов в стоках ОАО «Новоуфимский НПЗ» и ОАО «Дубитель» при применении культуры A.

globiformis 17S

–  –  –

Заметное изменение содержания фенолов в сточных водах при использовании A. globiformis 17S наблюдалось после 3-х суток обработки.

Степень очистки сточных вод, достигаемая при применении штамма A.

globiformis 17S, составляла для стоков нефтехимического производства 88,4%, а производства дубильных экстрактов – 90,7%.

Культура B. subtilis 16 проявила активность в условиях сточных вод нефтехимического производства ОАО «Уфахимпром».

Таблица 6 – Результаты анализа содержания фенолов в стоках нефтехимического производства ОАО «Уфахимпром» при применении культуры B. subtilis 16

–  –  –

Из результатов, приведенных в таблице 6, видно, что степень очистки сточных вод от фенолов в течение 48 часов составила 66,4%, а к 5-м суткам экспозиции содержание фенолов падало более чем на 99%. Существенно улучшало эффективность процессов очистки добавление питательных солей.

Так, в течение 48 часов в условиях использования питательных солей уровень очистки в случае применения штамма B. subtilis 16 достигал 89,5%, а к концу срока (5 дней) стоки были освобождены от фенолов более чем на 99,9%.

Культура S. marcescens 22S была активна в реальных условиях сточных вод нефтехимического производства и производства дубильных экстрактов.

Таблица 7 – Результаты анализа содержания фенолов в стоках ОАО «Новоуфимский НПЗ» и ОАО «Дубитель» при применении культуры S.

marcescens 22S

–  –  –

Степень очистки сточных вод от фенолов, достигаемая при использовании штамма S. marcescens 22S, в течение 3 суток для стоков производства дубильных экстрактов составляла 87,3%, а при применении к стокам нефтехимического производства составляла 75,7% на 3-и сутки и 88,6% на 7-е сутки обработки (табл. 7).

Деградацию 2,4,5-Т в почве осуществляли культуры B. cereus 34T и G.

oxydans 2T.

Существенное изменение содержания 2,4,5-Т наблюдалось после 10–14 дней обработки почвы B. cereus 34T. Через 5 суток инкубации количество 2,4,5Т уменьшалось на 35,8%, далее к 14-м суткам – примерно на 50% и впоследствии оставалось на этом уровне (табл. 8). Степень очистки почвы, достигаемая при использовании штамма G. oxydans 2T, составляла соответственно: 27,4% на 21-е сутки культивирования, 31,9% на 30-е сутки и около 66,5% на 48-е сутки.

Таблица 8 – Результаты анализа содержания 2,4,5-Т в почве при применении культуры B. cereus 34T и G. oxydans 2T

ВРЕМЯ ОБРАБОТКИ ПОЧВЫ, СУТКИ

ХАРАКТЕРИСТИКА

ПОЧВЫ

–  –  –

Приведенное выше показывает, что применение культур B. cereus 34T и G. oxydans 2Т является перспективным для очистки почвы от 2,4,5-Т.

5.2. Использование штамма Bacillus subtilis 16 для создания штамма деструктора с заданными свойствами in vitro Создание рекомбинантного штамма-деструктора проводили путем клонирования детерминант деградации 2,4-Д штамма Bacillus subtilis 16 в составе вектора pBR322 в клетках E.coli HB101.

Рекомбинантные клетки Е.coli селектировали на жидкой среде М9, содержащей 2,4-Д в качестве единственного источника углерода и энергии.

Сравнительный анализ содержания 2,4-Д и продуктов ее деградации в пробах культуральной жидкости E.coli pMK 16 показал, что количество 2,4-Д к 14 суткам инкубации снижалось на 88,9%. Для штамма B. subtilis 16 к 14-м суткам инкубации концентрация 2,4-Д в культуральной жидкости снижалась примерно на 78% от начального уровня.

С использованием метода газо-жидкостной хроматографии и хроматомасс-спектрометрии проведено сравнение продуктов метаболизма 2,4-Д, накапливаемых в культуральной жидкости B. subtilis 16, E.coli pBR322 и E.coli pMK16, и обнаружено их сходство, а именно, в качестве интермедиата штаммы образовывали 5-оксиметил-2,4-дихлорфеноксиуксусную кислоту.

Приведенные данные указывают на то, что штаммы E.coli pMK 16 и штамм B. subtilis 16 обладают соизмеримой деструктивной способностью в отношении 2,4-Д и образуют одинаковые интермедиаты конверсии.

Анализ структуры рекомбинантной плазмиды штамма E.coli рМК16 показал, что плазмида штамма E.coli рМК16 имеет размер 8,8 т.п.н. и состоит из векторной молекулы pBR 322 (А) и двух BamHI-фрагментов, размер которых составляет 3,1 т.п.н. (В) и 1,3 т.п.н. (С).

Новый рекомбинантный клон Е.coli с генотипом 2,4-Д+, был обозначен как штамм Е.coli рМК16.

На основе приведенных сведений, демонстрирующих примеры практического использования новых штаммов-деструкторов, становится возможным сформулировать область их применения в целом, а именно:

очистка/доочистка сточных вод предприятий химического и нефтехимического профиля от фенола и его хлорированных производных;

детоксикация и очистка почвы от фенола и его хлорированных производных в случаях локального загрязнения;

создание новых штаммов-деструкторов с заданными свойствами in vitro.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Присутствие в окружающей среде стойких синтетических соединений ароматического ряда создает одну из трудноразрешимых проблем в области поддержания качества среды обитания человека.

К настоящему времени сформировано представление о том, микроорганизмы, обладающие специфическими катаболическими способностями в отношении ксенобиотиков, могут использоваться для защиты и очистки среды в качестве действующих элементов биологических технологий нового поколения.

Вместе с тем, анализ результатов экспериментальных работ в области биоконверсии экотоксикантов обнаруживает слабую исследованность фундаментальных вопросов, связанных с описанием свойств отдельных культур, утилизирующих поллютанты, а также недостаточность знаний об организации и функционировании их консорциумов. Проявляется также неполное понимание сути механизмов биохимических превращений молекул загрязнителей, недостаточны сведения об особенностях генетического строения деструкторов.

В ходе настоящей работы из смешанных популяций почвенной биоты, подвергавшейся длительному воздействию техногенных факторов, были выделены новые бактериальные культуры, способные к ассимиляции фенола и его галогенидов.

Изучение характеристик вновь выделенных штаммов позволило существенно расширить представления о биоразнообразии современных деструкторов.

В частности, с применением молекулярных критериев систематики были дифференцированы новые виды гамма-подкласса протеобактерий родов Citrobacter, Stenotrophomonas и Xanthomonas.

Впервые было обнаружено, что представители родов Agrobacterium, Agromyces, Azospirillum, Brenneria, Enterobacter, Gluconobacter, Pantoea, Raoultella, Serratia, Stenotrophomonas и Xanthomonas способны вовлекать в обмен веществ и энергии фенол, 2,4-ДХФ, 4-ХФУК, 2,4-Д и 2,4,5-Т.

Для представителей родов Achromobacter, Agrobacterium, Bacillus, Citrobacter, Gluconobacter, Raoultella, Serratia, Stenotrophomonas и Xanthomonas впервые были описаны этапы ассимиляции хлорфеноксикислот и показано, что конверсия молекул ксенобиотиков происходит с образованием дегалогенированных производных феноксиуксусной кислоты, которые впоследствии подвергаются расщеплению до альдегида гексеновой кислоты, диоксогексендионовой кислоты или гексеналя. При этом впервые был обнаружен мета-путь конверсии 2,4,5-Т у штаммов родов Achromobacter, Gluconobacter, Pseudomonas, Raoultella, Stenotrophomonas и Xanthomonas, а также установлено, что конверсия хлорфеноксикислот у представителей рода Bacillus происходит через формирование гидроксилированных производных.

В геномах бактерий, принадлежащих родам Citrobacter, Pseudomonas, Raoultella, Serratia, Stenotrophomonas и Xanthomonas, обнаружены оригинальные плазмиды, несущие генетические детерминанты контроля над реакциями ассимиляции хлорфеноксиуксусных кислот. Эти плазмиды были классифицированы как новые D-плазмиды бактерий-деструкторов.

плазмиды штаммов рода Raoultella способны к Обнаружено, что горизонтальному переносу и экспрессии детерминант деградации хлорфеноксикислот в других бактериальных хозяевах в полном объеме.

Показано, что генетические системы контроля конверсии ксенобиотиков вновь обнаруженных штаммов существенно отличаются от известных.

Следует подчеркнуть, что в настоящей работе изучение природных деструкторов было нацелено не только на понимание теоретических основ многообразия проявлений жизни, но и связывалось со стремлением использовать полученные данные на практике в качестве ключа, который открывает возможности разработки безопасных технологий сохранения окружающей среды. Поэтому была изучена принципиальная возможность использования новых штаммов-деструкторов для доочистки от фенолов стоков предприятий нефтехимического профиля, а также показаны перспективы применения их генетических элементов для дизайна штаммов с заданными свойствами in vitro.

ВЫВОДЫ

1. Из смешанных популяций почвенных микроорганизмов промзоны г. Уфы выделены новые штаммы бактерий-деструкторов фенола, 2,4-дихлорфенола и хлорфеноксиуксусных кислот, а именно: Achromobacter xyloxidans 33P, Agrobacterium tumefaciens 21SG, Agromyces sp. 34DCP, Arthrobacter globiformis 17S, Azospirillum irakense 38D, Bacillus cereus 33T, Bacillus subtilis 16, Brenneria salcis 38P, Citrobacter sp. 36 4CPA, Enterobacter asburia 33D, Enterobacter cloacae 34 4CPA, Gluconobacter oxydans 2T, Pantoea agglomerans 36P, Pseudomonas aeruginosa 36DCP, Pseudomonas fluorescens 39D, Pseudomonas kilonensis 34T, Pseudomonas putida 19S, Raoultella planticola 33 4CPA, Raoultella planticola 36D, Raoultella planticola 36T, Rhodococcus rubropertinctus 5D, Serratia marcescens 22S, Stenotrophomonas sp. 33T и Xanthomonas sp. 33DCP.

2. Согласно фенотипическим признакам и филогенетической обособленности, выявляемой по молекулярным критериям систематики, штаммы Citrobacter sp.36 4CPA, Stenotrophomonas sp. 33Т и Xanthomonas sp. 33DCP дифференцированы как новые виды гамма-подкласса протеобактерий родов Citrobacter, Stenotrophomonas и Xanthomonas.

3. Впервые установлено, что представители родов Agrobacterium, Agromyces, Azospirillum, Brenneria, Enterobacter, Gluconobacter, Pantoea, Raoultella, Serratia, Stenotrophomonas и Xanthomonas способны вовлекать в обмен веществ и энергии фенол, 2,4-дихлорфенол, 4-хлорфеноксиуксусную, 2,4дихлорфеноксиуксусную и 2,4,5-трихлорфеноксиуксусную кислоты.

4. Установлено, что ассимиляция хлорфеноксиуксусных кислот Achromobacter xyloxidans 33P, Agrobacterium tumefaciens 21SG, Citrobacter sp. 36 4CPA, Gluconobacter oxydans 2T, Pseudomonas kilonensis 34T, Raoultella planticola 33 4CPA, Raoultella planticola 36D, Raoultella planticola 36T, Serratia marcescens 22S, Stenotrophomonas sp. 33T и Xanthomonas sp. 33DCP происходит с образованием дегалогенированных производных феноксиуксусной кислоты, которые подвергаются расщеплению до альдегида гексеновой кислоты, диоксогексендионовой кислоты или гексеналя. Конверсия хлорфеноксикислот Bacillus subtilis 16 происходит через формирование гидроксилированных производных хлорфеноксиуксусной кислоты.

5. Показано, что штаммы-деструкторы Citrobacter sp. 36 4CPA, Serratia marcescens 22S, Raoultella planticola 36T, Raoultella planticola 36D, Raoultella planticola 33 4CPA, Stenotrophomonas sp. 33Т, Pseudomonas kilonensis 34Т и Xanthomonas sp. 33DCP обладают оригинальными плазмидами, несущими детерминанты контроля над реакциями ассимиляции хлорфеноксиуксусных кислот. Обнаружено, что плазмиды штаммов Raoultella planticola 33 4CPA, Raoultella planticola 36D и Raoultella planticola 36T способны к горизонтальному переносу и экспрессии детерминант деградации хлорфеноксикислот в других бактериальных хозяевах.

6. С использованием генетических кластеров штамма Bacillus subtilis 16 создан новый рекомбинантный штамм-деструктор E.coli pMK 16, осуществляющий конверсию молекул 2,4-Д.

7. Определена принципиальная возможность использования новых штаммовдеструкторов для доочистки от фенолов стоков предприятий нефтехимического профиля (Bacillus subtilis 16, Arthrobacter globiformis 17S, Agrobacterium tumefaciens 21 SG, Serratia marcescens 22S) и почвы (Bacillus cereus 33Т, Gluconobacter oxydans 2T).

СПИСОК ОСНОВНЫХ ПУБЛИКАЦИЙ

ПО МАТЕРИАЛАМ ДИССЕРТАЦИИ

Статьи в периодических научных изданиях

1. Ясаков Т.Р., Куликов Е.Е., Летаров А.В., Журенко Е.Ю., Коробов В.В., Жарикова Н.В., Анисимова Л.Г., Гарафутдинов Р.Р., Маркушева Т.В. Новый бактериальный штамм-деструктор 2,4,5-трихлорфеноксиуксусной кислоты // Известия Самарского научного центра Российской академии наук. 2011. Т.13 № 1(5). C. (в печати).

2. Жарикова Н.В., Журенко Е.Ю., Коробов В.В., Ясаков Т.Р., Анисимова Л.Г., Маркушева Т.В., Абрамов С.Н. Выделение и анализ биодеградационного потенциала нового природного штамма-деструктора хлорфеноксикислот рода Rhodococcus // Известия Самарского научного центра Российской академии наук

2011. Т.13 № 1(5). C. (в печати).

3. Маркушева Т.В., Журенко Е.Ю., Жарикова Н.В., Коробов В.В., Ясаков Т.Р., Анисимова Л.Г. Штаммы-деструкторы хлорфеноксикислот гамма – подкласса протеобактерий // Известия Самарского научного центра Российской академии наук 2011. Т.13 № 1(5). C. (в печати).

4. Журенко Е.Ю., Коробов В.В., Жарикова Н.В., Ясаков Т.Р., Анисимова Л.Г., Маркушева Т.В. Особенности структуры микробиоты техногенной экосистемы Северного промузла РБ: бактерии-деструкторы фенола и 2,4-дихлорфенола // Известия Самарского научного центра Российской академии наук 2011. Т.13 № 1(5). C. (в печати).

5. Жарикова Н.В., Журенко Е.Ю., Коробов В.В., Ясаков Т.Р., Анисимова Л.Г., Маркушева Т.В. Биоразнообразие бактерий-деструкторов хлорированных феноксикислот // Вестник Оренбургского государственного университета. 2009.

№6. С. 121-123.

6. Жарикова Н.В., Коробов В.В., Анисимова Л.Г., Ясаков Т.Р., Журенко Е.Ю, Маркушева Т.В. Молекулярно-биологический подход при изучении бактерийдеструкторов хлорароматических соединений // Аграрная Россия. 2009. №S.

С. 119.

7. Коробов В.В., Журенко Е.Ю, Жарикова Н.В., Анисимова Л.Г., Ясаков Т.Р., Маркушева Т.В. Анализ состава интермедиатов биоконверсии хлорароматических производных // Аграрная Россия. 2009. №S. С. 121.

8. Журенко Е.Ю., Жарикова Н.В., Коробов В.В., Ясаков Т.Р., Анисимова Л.Г., Маркушева Т.В. Анализ бактерий-деструкторов техногенной экосистемы // Вестник Оренбургского государственного университета. 2009. №S. С. 444Ясаков Т.Р., Анисимова Л.Г., Журенко Е.Ю., Маркушева Т.В., Коробов В.В., Жарикова Н.В. Особенности скрининга бактериальных деструкторов ксенобиотиков // Аграрная Россия. 2009. №S. С. 135.

10. Жарикова Н.В., Маркушева Т.В., Галкин Е.Г., Коробов В.В., Журенко Е.Ю., Ситдикова Л.Р., Колганова Т.В., Кузнецов Б.Б., Турова Т.П. Raoutella planticola – новый штамм-деструктор 2,4,5-трихлорфеноксиуксусной кислоты // Прикладная биохимия и микробиология. 2006. Т. 42. № 3. С. 292-297.

11. Коробов В.В., Маркушева Т.В., Кусова И.В., Журенко Е.Ю., Галкин Е.Г., Жарикова Н.В., Гафиятова Л.Р. Штамм бактерий Serratia marcescens В-6493 – деструктор фенола и 2,4-дихлорфенола // Биотехнология. 2006. № 2. С.63-65.

12. Тропынина Т.С., Иванова Э.А., Вафина Г.Х., Иванов Р.С., Ясаков Т.Р., Маркушева Т.В. Системный подход в биохимических исследованиях протеолитического процессинга протеома живых систем // Вестник биотехнологии и физико-химической биологии им. Ю.А. Овчинникова. 2006. Т. 2 №4. С.

14-15.

13. Маркушева Т.В., Журенко Е.Ю., Галкин Е.Г., Коробов В.В., Жарикова Н.В., Гафиятова Л.Р. Идентификация и характеристика плазмиды штамма Aeromonas hydrophila IBRB–36-4CPA, несущей гены катаболизма хлорфеноксиуксусных кислот // Генетика. – 2004. Т. 40. № 11. – С. 1469-1474.

14. Журенко Е.Ю., Маркушева Т.В., Галкин Е.Г., Коробов В.В., Жарикова Н.В., Гафиятова Л.Р. Gluconobacter oxydans IBRB-2T деструктор 2,4,5трихлорфеноксиуксусной кислоты // Биотехнология. 2003. № 6. С. 67-71.

Патенты

1. Маркушева Т.В., Кусова И.В., Журенко Е.Ю., Чураев Р.Н. Способ обнаружения генов катаболизма 2,4-Д в геномах эукариот // Патент РФ № 2125263, Бюл.№2, 20.01.1999.

2. Маркушева Т.В., Журенко Е.Ю., Кусова И.В., Чураев Р.Н. Штамм бактерий Bacillus cereus, осуществляющий биологическую деградацию 2,4,5-Т // Патент РФ № 2129605, Бюл. № 12, 24.04.1999.

3. Маркушева Т.В., Журенко Е.Ю., Кусова И.В., Чураев Р.Н. Штамм бактерий Gluconobacter oxydans, осуществляющий биологическую деградацию 2,4,5-Т // Патент РФ №2130067, Бюл. №13, 10.05.1999.

4. Маркушева Т.В., Кусова И.В., Журенко Е.Ю., Чураев Р.Н. Способ обнаружения генов катаболизма 2,4-Д в геномах микроорганизмов // Патент РФ № 2130074, Бюл. №13, 10.05.1999.

5. Маркушева Т.В., Журенко Е.Ю., Кусова И.В., Чураев Р.Н. Штамм бактерий Serratia marcescens, осуществляющий биологическую деградацию фенола и 2,4дихлорфенола // Патент № 2074254, Бюл. № 6, 27.02.1997.

6. Маркушева Т.В., Журенко Е.Ю., Султанбекова М.Н., Кусова И.В., Каткова Е.Г., Никитина В.С., Чураев Р.Н. Штамм бактерий Arthrobacter globiformis, осуществляющий биологическую деградацию фенола и 2,4-дихлорфенола // Патент РФ № 2076523, Бюл. № 9, 27.03.1997.

7. Маркушева Т.В., Журенко Е.Ю., Султанбекова М.Н., Каткова Е.Г., Кусова И.В., Чураев Р.Н. Штамм бактерий Agrobacterium tumefaciens, осуществляющий биологическую деградацию фенола // Патент РФ № 2077575, Бюл. № 11, 20.04.1997.

8. Маркушева Т.В., Кусова И.В., Никитина В.С., Султанбекова М.Н., Чураев Р.Н., Журенко Е.Ю., Каткова Е.Г., Шакирова Р.С. Штамм бактерий Escherichia coli, осуществляющий биодеградацию 2,4-дихлорфеноксиуксусной кислоты, рекомбинантная плазмидная ДНК рМК16, содержащая гены биодеградации 2,4дихлорфеноксиуксусной кислоты и способ конструирования рекомбинантной ДНК рМК16, содержащей гены биодеградации 2,4-дихлорфеноксиуксусной кислоты // Патент РФ № 2064501, Бюл. № 21, 27.07.1996.

9. Маркушева Т.В., Никитина В.С., Скворцова И.Н., Чураев Р.Н., Кусова И.В., Журенко Е.Ю., Ягафарова Г.Г., Хлесткин Р.Н., Мавзютов А.Р., Габидуллин З.Г.

Штамм бактерии Bacillus subtilis, осуществляющий деградацию 2,4дихлорфеноксиуксусной кислоты // Патент РФ № 1742226, Бюл. № 23, 23.06.1992.

Работа, депонированная в ВИНИТИ:

1. Муллагалиев И.Р., Монаков Ю.Б., Хафизова Г.Г., Журенко Е.Ю., Маркушева Т.В., Хусаинова И.А. Иммобилизация некоторых микроорганизмов на полимерных матрицах // Деп. в ВИНИТИ. 11.06.1993. № 1638-В93.

Монография

1. Маркушева Т.В., Журенко Е.Ю., Кусова И.В. Бактерии-деструкторы фенола и его хлорированных производных // Уфа: Гилем, 2002. 108 с.

Публикации в научных электронных изданиях

1. Zharikova,N., Korobov,V., Yasakov,T., Anisimova,L., Kolganova,T., Zhurenko,E., Kuznetsov,B. and Markusheva,T.V. Citrobacter sp. 36-4CPA 16S ribosomal RNA gene, partial sequence. Accession number JF812082, GenBank, 2011.

2. Yasakov,T.R., Kulikov,E.E., Letarov,A.V., Zharikova,N.V., Zhurenko,E.Y., Korobov,V.V., Anisimova,L.G. and Markusheva,T.V. Pseudomonas kilonensis 34T new bacterial degrader of 2,4-D and 2,4,5-T 16S ribosomal RNA gene, partial sequence.

GenBank. 2011. Accession number HQ891022. GenBank, 2011.

3. Yasakov,T.R., Kulikov,E.E., Letarov,A.V., Zharikova,N.V., Zhurenko,E.Y., Korobov,V.V., Anisimova,L.G. and Markusheva,T.V. Xanthomonas sp. 33DCP - new bacterial degrader of chlorophenoxyalcanoic acids 16S ribosomal RNA gene, partial sequence. Accession number HQ891021. GenBank, 2011.

4. Yasakov,T.R., Kulikov,E.E., Letarov,A.V., Zharikova,N.V., Zhurenko,E.Y., Korobov,V.V., Anisimova,L.G. and Markusheva,T.V. Stenotrophomonas sp. 33T new bacterial degrader of 2,4,5-T 16S ribosomal RNA gene, partial sequence. Accession number HQ877451. GenBank, 2011.

5. Anisimova, L., Zhurenko, E., Kolganova, T., Bumazhkin, B., Patutina E., Korobov, V., Zharikova, N., Yasakov, T., Kuznetsov, B. and Markusheva, T.V. The conjugative plasmid of 2,4-D and 2,4,5-trichlorophenoxyacetic acid degradating bacterium Serratia marcescens ssp. B-6493. Accession number HQ896493. GenBank, 2010.

Zharikova N.V., Markusheva T.V., Galkin E.G., Korobov V.V., Zhurenko E.U., 6.

Sitdikova L.R., Kolganova T.V., Kuznetsov B.B., Tourova T.P. Raoultella planticola strain 33-4ch 16S ribosomal RNA gene, partial sequence. Accession number DQ333356.

GenBank, 2006.

Markusheva T.V., Zhurenko E.Yu., Kusova I.V. Strains IBUNC //Сonsolidated 7.

Catalogue of Microbial Cultures Held in Russian Non-medical Collections / Edit. L.V.

Kalakoutskii E. Book Vol. I. Bacteria, 2001.Р. 3915-4077.Режим доступа:

http://www.vkm.ru/eCatalogue.htm.

Публикации в научных сборниках и материалах конференций

1. Жарикова Н.В., Коробов В.В., Анисимова Л.Г., Ясаков Т.Р., Журенко Е.Ю., Маркушева Т.В. Возможность использования культуры Gluconobacter oxydans 2Т в области ремедиации почв от гербицида 2,4,5-Т // Сборник трудов VI Международной конференции «Факторы экспериментальной эволюции организмов». Киев, 2010. С. 248-252.

2. Актуганов Г.Э., Жарикова Н.В., Журенко Е.Ю., Коробов В.В., Ясаков Т.Р., Маркушева Т.В., Мелентьев А.И. Хитинолитическая активность и антагонистический потенциал бактерий-деструкторов хлорированных феноксикислот // Материалы Десятой Международной конференции «Современные перспективы в исследовании хитина и хитозана». Нижний Новгород, 2010. С. 250-254.

3. Челатканова Е.Н., Романова Н.Б., Кусова И.В., Коробов В.В., Маркушева Т.В.

Исследование процесса микробного дегалогенирования хлорсодержащих ароматических соединений // Материалы 9-й международной научной конференции «Сахаровские чтения 2009 года: экологические проблемы XXI века».

Минск, 2009 С. 199-200.

4. Жарикова Н.В., Коробов В.В., Анисимова Л.Г., Ясаков Т.Р., Журенко Е.Ю., Маркушева Т.В. Возможность использования культуры Bacillus cereus IBRB-34T в области ремедиации почв от гербицида 2,4,5-Т // Сборник трудов V Международной конференции «Факторы экспериментальной эволюции организмов». Киев, 2009. Т.6. С. 303-308.

5. Мавлявиева Р.Р., Анисимова Л.Г., Легушс Э.Ф., Журенко Е.Ю., Ясаков Т.Р., Маркушева Т.В. Исследование биотических взаимоотношений при разработке биологического препарата для очистки сточных вод от ионов тяжелых металлов // Сборник статей V Международной научно-технической конференции «Наука, образование, производство в решении экологических проблем» (Экология - 2008).

Уфа, 2008. С. 227-228.

6. Жарикова Н.В., Коробов В.В., Анисимова Л.Г., Ясаков Т.Р., Журенко Е.Ю., Маркушева Т.В. Молекулярно-генетическая организация новой плазмиды деградации хлорфеноксиуксусных кислот // Сборник трудов международной конференции «Факторы экспериментальной эволюции». Киев, 2008. С. 139Жарикова Н.В., Маркушева Т.В., Кузнецов Б.Б. Характеристика области репликации плазмиды pAH 36-4CPA штамма Citrobacter hydrophila IBRB-36 4CPA // Материалы Международной школы-конференции «Генетика микроорганизмов и биотехнология». Москва, 2008. С. 135-136.

8. Маркушева Т.В., Жарикова Н.В., Журенко Е.Ю., Галкин Е.Г., Коробов В.В., Анисимова Л.Г., Ясаков Т.Р. Плазмида Citrobacter hydrophila IBRB–364CPA, несущая гены конверсии хлорфеноксиуксусной кислоты, устойчивости к антибиотикам и тяжелым металлам // Материалы III Международной конференции «Микробное разнообразие: состояние, стратегия сохранения, биотехнологический потенциал». Пермь, 2008. С. 69-71.

9. Мавлявиева Р.Р., Анисимова Л.Г., Легушс Э.Ф., Журенко Е.Ю., Ясаков Т.Р., Маркушева Т.В. Исследование биотических взаимоотношений при разработке биологического препарата для очистки сточных вод от ионов тяжелых металлов // Труды 51-й научной конференции МФТИ «Современные проблемы фундаментальных и прикладных наук». Часть IV «Молекулярная и биологическая физика». Москва-Долгопрудный, 2008. С. 20-22.

10. Жарикова Н.В., Коробов В.В., Ситдикова Л.Р., Ясаков Т.Р., Анисимова Л.Г., Галкин Е.Г., Журенко Е.Ю., Маркушева Т.В. Характеристика генетической системы мобилизации плазмиды pAH 36-4CPA // Материалы школы-семинара молодых ученых Уфимского научного центра РАН и волго-Уральского региона по физико-химической биологии и биотехнологии «Биомика - наука XXI века».

Уфа, 2007. С. 46-48.

11. Чегодаева К.А., Бунакова О.И., Маркушева Т.В., Легушс Э.Ф., Фатхутдинова А.Ф., Журенко Е.Ю., Кусова И.В. Микробиологические методы очистки сточных вод // Материалы II Международной научно-практической конференции «Актуальные экологические проблемы». Уфа, 2007. С. 164-167.

12. Чегодаева К.А., Бунакова О.И., Маркушева Т.В., Журенко Е.Ю., Легушс Э.Ф., Коробов В.В., Кусова И.В. Исследование способности штаммов бактерий к извлечению ионов тяжелых металлов из водных растворов // Сборник статей Международной научно-технической конференции «Наука, образование, производство в решении экологических проблем». Уфа, 2007. С. 258-262.

13. Чегодаева К.А., Бунакова О.И., Легушс Э.Ф., Маркушева Т.В., Журенко Е.Ю., Коробов В.В. Использование микроорганизмов в очистке сточных вод от тяжелых металлов // Сборник статей Международной научно-технической конференции «Наука, образование, производство в решении экологических проблем». Уфа,

2007. С. 268-271.

14. Фатхутдинова А.Ф., Бунакова О.И., Легушс Э.Ф., Маркушева Т.В.

Микробиологические методы очистки сточных вод // Материалы III Международной научно-технической конференции «Наука, образование, производство в решении экологических проблем» (экология-2006). Уфа, 2006.

Т. 2. С. 110-114.

15. Красногорская Н.Н., Кусова И.В., Легушс Э.Ф., Фащевская Т.Б., Маркушева Т.В.

Реализация комплексного подхода при преподавании дисциплины «Источники загрязнения среды обитания» // Материалы III Международной научно-технической конференции «Наука, образование, производство в решении экологических проблем» (экология-2006). Уфа, 2006. Т. 2. С. 205-206.

16. Фатхутдинова А.Ф., Легушс Э.Ф., Маркушева Т.В., Журенко Е. Ю., Кусова И.В.

Биологический метод очистки сточных вод от ионов тяжелых металлов // Материалы международной научно-практической конференции «Нефтегазопереработка и нефтехимия-2006». Уфа, 2006. С. 225-227.

17. Павлова А.М., Нургалин Р.И., Кусова И.В., Маркушева Т.В. Анализ загрязнения промышленной зоны г. Уфы и способы ее очистки // Материалы III Международной научно-технической конференции «Наука образование, производство в решении экологических проблем» (экология 2006). Уфа, 2006.

Т. 2. С. 81-82.

18. Фатхутдинова А.Ф., Легушс Э.Ф., Журенко Е.Ю., Маркушева Т.В., Кусова И.В.

Изучение способности бактерий Klebsiella terrigena dub.(36T), Bacillus cereus nunps (33T), Bacillus cereus shug (34T), Gluconobacter oxydans, Serratia marcescens к извлечению ионов тяжелых металлов из водной среды // Материалы 6-ой международной конференции «Сахаровские чтения 2006 года: экологические проблемы XXI века». Минск, 2006. С. 258-259.

19. Вдовина И.В., Фатхутдинова А.Ф., Маркушева Т.В., Легушс Э.Ф., Красногорская Н.Н. Изучение бактерий для разработки экологически безопасного метода доочистки сточных вод от тяжелых металлов // Материалы Всероссийской научнопрактической конференции «Техносферная безопасность, надежность, качество, энергосбережение». Ростов-на-Дону, 2005. С. 216-219.

20. Коробов В.В., Жарикова Н.В., Гафиятова Л.Р., Журенко Е.Ю., Маджар В.В., Михалев А.А., Маркушева Т.В. Плазмида штамма Aeromonas hydrophila IBRB-36 4CPA и ее свойства // Материалы 2-й конференции Московского общества генетиков и селекционеров им. Н.И. Вавилова «Актуальные проблемы генетики».

Москва, 2003. Т. 2. С. 84-85.

21. Галкин Е.Г., Журенко Е.Ю., Коробов В.В., Жарикова Н.В., Маркушева Т.В.

Масс-спектрометрия в исследованиях процессов биологической конверсии пестицидов (2,4Д; 2,4,5Т) // Школа-семинар «Масс-спектрометрия в химической физике, биофизике и экологии»: сб. Материалов Школы-семинара. Звенигород,

2002. С. 51-52.

22. Журенко Е.Ю., Галкин Е.Г., Коробов В.В., Жарикова Н.В., Маркушева Т.В.

Биоремедиация: конверсия фенола и его хлорированных производных // Труды Всероссийской конференции «Научные аспекты экологических проблем России» / под ред. Ю.А. Израэля. М: Наука, 2002. С. 562-566.

23. Журенко Е.Ю., Кусова И.В., Коробов В.В., Жарикова Н.Н., Маркушева Т.В.

Бактерии-деструкторы фенола и его хлорированных производных промзоны г.

Уфы // Материалы конференции «Биоразнообразие и биоресурсы Урала и его сопредельных территорий». Оренбург, 2001. – С. 10-14.

24. Kусова И.В., Журенко Е.Ю., Маркушева Т.В. Молекулярный зонд для поиска штаммов-деструкторов 2,4-Д // Материалы Международной конференции Молекулярная генетика и биотехнология. Минск, 1998. С. 59-60.

25. Markusheva T.V., Kusova I.V.,Tchuraev R.N. Comparative investigation of genes of 2,4-D degradation in plant and animals cells // Proceedings of Satellite Meeting of the

XV IUB Congress of Biochemistry «Biochem.and Biophys. of Cytochrome P-450:

Struc.and Funct., Biotechnol.and Ecology Aspects». Moscow, 1992. P. 416-418.

26. Никитина В.С., Яруллина Г.К., Журенко Е.Ю., Маркушева Т.В. Фотометрическое определение микроколичеств 2,4-дихлорфенола при исследовании биодеградации хлорсодержащих ароматических соединений // Основные направления биотехнологии в решении народнохозяйственных задач: сб. статей Уфа, 1991.

С. 87-92.

27. Журенко Е.Ю., Кусова И.В., Султанбекова М.Н., Каткова Е.Г., Совенко О.С., Маркушева Т.В. Поиск и исследование микроорганизмов для деградации гербицида 2,4-Д // Основные направления биотехнологии в решении народнохозяйственных задач: сб. статей Уфа, 1991. С. 81-86.

28. Маркушева Т.В., Никитина В.С., Султанбекова М.Н., Кусова И.В., Журенко Е.Ю., Каткова Е.Г., Чураев Р.Н. Молекулярно-генетическая характеристика клонированных генов деградации 2,4-Д штамма Bacillus sp. // Материалы VII Всесоюзного симпозиума «Молекулярные механизмы генетических процессов».

Москва, 1990. С. 242-243.

29. Маркушева Т. В., Кусова И.В., Никитина В.С., Чураев Р.Н. Конструирование плазмиды биодеградации 2,4-дихлорфеноксиуксусной кислоты // Материалы конференции «Генная и клеточная инженерия в решении фундаментальных проблем биотехнологии». Тарту, 1989. Т.1. С. 163-165.

Избранные тезисы докладов и стендовых сообщений

1. Маркушева Т.В., Журенко Е.Ю., Коробов В.В., Жарикова Н.В., Анисимова Л.Г., Ясаков Т.Р., Маджар В.В., Абрамов С.Н. Особенности организации плазмид бактерий деструкторов ароматических соединений рода Bacillus // Материалы V съезда Вавиловского общества генетиков и селекционеров. Москва, 2009.

Часть I. С. 33.

2. Мавлявиева Р.Р., Легушс Э.Ф., Маркушева Т.В., Сафарова В.И. Исследование способности бактерий к извлечению тяжелых металлов из водных растворов // Материалы VI Республиканской научно-практической конференции «Проблемы безопасности и защиты населения и территорий от чрезвычайных ситуаций».

Уфа, 2009. С. 22-24.

3. Маркушева Т.В., Ясаков Т.Р., Анисимова Л.Г., Жарикова Н.В., Коробов В.В., Журенко Е.Ю. Биоразнообразие бактерий - деструкторов хлорфеноксиуксусных кислот // Вестник Российской военно-медицинской академии. 2008. № 3 (23).

ч. II. С. 342.

4. Анисимова Л.А., Ясаков Т.Р., Жарикова Н.В., Коробов В.В., Журенко Е.Ю., Маркушева Т.В. Бактериальные штаммы для ремедиации почв, загрязненных органическими токсикантами // Тезисы докладов I Всероссийской научнопрактической конференции с международным участием «Фундаментальные достижения в почвоведении, экологии, сельском хозяйстве на пути к инновациям». Москва, 2008. С. 8 - 9.

5. Анисимова Л.Г., Ясаков Т.Р., Жарикова Н.В., Коробов В.В., Журенко Е.Ю., Маркушева Т.В. Сравнительный анализ плазмид штаммов – деструкторов хлорфеноксиуксусных кислот родов Pseudomonas и Serratiа // Материалы Международной школы-конференции «Генетика микроорганизмов и биотехнология». Москва, 2008. С. 18.

6. Галкин Е.Г., Коробов В.В., Жарикова Н.В., Журенко Е.Ю., Ясаков Т. Р., Анисимова Л.Г., Маркушева Т.В. Масс-спектрометрия в исследованиях процессов биологической конверсии пестицидов (2,4-Д; 2,4,5-Т). Сообщение 3.

Идентификация интермедиатов катаболизма пестицида 2,4-Д рекомбинантного штамма-деструктора при помощи хроматомасс-спетрометрии //Материалы 3-й Международной школы-конференции «Масс-спектрометрия в химической физике, биофизике и экологии». Звенигород, 2007. С. 244.

7. Маркушева Т.В., Журенко Е.Ю., Галкин Е.Г.,. Коробов В.В, Жарикова Н.В., Анисимова Л.А., Гафиятова Л.Р. Сравнительная характеристика плазмид бактерий-деструкторов хлорфеноксиуксусных кислот родов Citrobacter, Pseudomonas и Serratia // Тезисы Российской школы-конференции «Генетика микроорганизмов и биотехнология», посвященной 100-летию со дня рождения С.И. Алиханяна. Москва-Пущино, 2006. С. 64.

8. Жарикова Н.В., Коробов В.В., Ситдикова Л.Р., Маркушева Т.В. Citrobacter hydrophila IBRB-36 4CPA – новый штамм-деструктор хлорированных феноксиуксусных кислот // Тезисы докладов Всероссийской Молодежной школыконференции «Актуальные аспекты современной микробиологии». Москва,

2005. С. 88.

9. Маркушева Т.В., Жарикова Н.В., Коробов В.В., Ситдикова Л.Р., Журенко Е.Ю.

Идентификация и сравнительный анализ D-плазмид бактерий-деструкторов рода Raoultella // Материалы международной конференции «Проблемы биодеструкции техногенных загрязнителей окружающей среды» Саратов, 2005. С. 86.

10. Маркушева Т.В., Кусова И.В., Журенко Е.Ю., Коробов В.В., Жарикова Н.В., Ситдикова Л.Р. Молекулярный зонд для поиска штаммов-деструкторов 2,4дихлорфеноксиуксусной кислоты // Тезисы докладов Второй Международной конференции Наука–Бизнес–Образование, Биотехнология–Биомедицина– Окружающая среда. Пущино, 2005. С. 34.

11. Маркушева Т.В., Жарикова Н.В., Коробов В.В., Гафиятова Л.Р., Лубянов Е.А., Журенко Е.Ю., Маджар В.В. Плазмида штамма Serratia marcescens IBRB-22S, несущая гены конверсии хлорфеноксиуксусных кислот и устойчивости к тяжелым металлам // Материалы III съезда ВОГиС «Генетика в XXI веке: современное состояние и перспективы развития». Москва, 2004. Т. 1. С. 394.

12. Gafiyatova L.R., Zharikova N.V., Korobov V.V., Lubyanov E.A., Zhurenko E.Yu., Madjar V.V, Markusheva T.V. Aeromonas hydrophila IBRB–36 4CPA plasmid, carrying genes of chlorоphenoxyacetic acid conversion antibiotic and heavy metals resistance // ELSO Meeting. France, 2004. P. 260, режим доступа org/index.php.

13. Маркушева Т.В., Журенко Е.Ю., Кусова И.В., Коробов В.В., Жарикова Н.В., Гафиятова Л.Р. Биоочистка стоков нефтехимического производства // Материалы Всероссийской научно-практической конференции «Реновация: отходытехнологии-доходы». Уфа, 2004. С. 68.

14. Маркушева Т.В., Журенко Е.Ю., Галкин Е.Г., Коробов В.В., Жарикова Н.В., Гафиятова Л.Р. Бактерии для ремедиации окружающей среды // Труды международной конференции «Поиск и использование новых биомолекул:

биоразнообразие, окружающая среда, биомедицина». Пущино, 2004. С. 57.

15. Галкин Е.Г., Коробов В.В., Жарикова Н.В., Гафиятова Л.Р., Журенко Е.Ю., Маркушева Т.В. Масс-спектрометрия в исследованиях процессов биологической конверсии пестицидов // Материалы 2-го международного Семинара-школы «Масс-спектрометрия в химической физике, биофизике и экологии». Москва,

2004. С. 265.

16. Zharikova N.V., Gafiyatova L.R., Korobov V.V., Galkin E.G., Madjar V.V., Zhurenko E.Yu., Markusheva T.V. Plasmids of Klebsiella strains-degrading chlorophenoxyacetic acids // ELSO Meeting. Germany, 2003. P. 264,режим доступа org/index.php.

17. Zharikova N.V., Korobov V.V., Zhurenko E.Yu., Gafiyatova L.R., Michalev A.A., Madjar V.V., Galkin E.G., Markusheva T.V. Bacteriadegrading phenol and its chlorinated derivatives // First FEMS Congress of European Microbiologists. Slovenia,

2003. P. 430.

18. Жарикова Н.В., Гафиятова Л.Р., Коробов В.В., Галкин Е.Г., Маджар В.В., Михалев А.А., Журенко Е.Ю., Маркушева Т.В. Плазмиды штаммов-деструкторов хлорфеноксиуксусных кислот бактерий рода Klebsiella // Сборник тезисов докладов 7-ой Пущинской школы-конференции молодых ученых «Биология – наука XXI века». Пущино, 2003. С. 273.



Pages:     | 1 || 3 |

Похожие работы:

«СТЕПАНОВА СВЕТЛАНА КИМОВНА ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ВАРИАБЕЛЬНОСТЬ ЛОКУСА МИОТОНИНПРОТЕИНКИНАЗЫ В ЯКУТСКОЙ ПОПУЛЯЦИИ 03.02.07 – генетика АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук Томск 2015 Работа выполнена в Федеральном государственном бюджетном научном учреждении «Якутский научный центр комплексных медицинских проблем» и в Федеральном государственном бюджетном научном учреждении «Научноисследовательский институт медицинской генетики» (г.Томск)...»

«Бадтиев Юрий Саламович МЕТОДОЛОГИЯ БИОДИАГНОСТИКИ КАЧЕСТВА ОКРУЖАЮЩЕЙ СРЕДЫ ВОЕННЫХ ОБЪЕКТОВ 03.00.16 – Экология, 05.26.02 Безопасность в чрезвычайных ситуациях АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени доктора биологических наук Москва 2006 Работа выполнялась в период с 1986 по 2006 г.г. в НИИ «Медстатистика», НИЦ информационных технологий экстремальных проблем, Экологическом центре...»

«Муравьев Игорь Владимирович БИОЭКОЛОГИЧЕСКИЕ ОСНОВЫ И МЕХАНИЗМЫ СИМПАТРИИ У ПТИЦ НА ПРИМЕРЕ ВИДОВ ГРУППЫ «ЖЕЛТЫХ» ТРЯСОГУЗОК (PASSERIFORMES: MOTACILLIDAE, MOTACILLINAE) 03.02.08 – экология (биология) Автореферат диссертации на соискание ученой степени доктора биологических наук Ульяновск – 2013   1 Работа выполнена на кафедре естественно-математического образования Государственного бюджетного образовательного учреждения дополнительного педагогического образования «Пензенский...»

«Джувеликян Хачик Акопович ЭКОЛОГИЧЕСКОЕ СОСТОЯНИЕ ПРИРОДНЫХ И АНТРОПОГЕННЫХ ЛАНДШАФТОВ ЦЕНТРАЛЬНОГО ЧЕРНОЗЕМЬЯ 03.00.16. – экология Автореферат диссертации на соискание ученой степени доктора биологических наук Петрозаводск – 2007 г. Работа выполнена в Воронежском государственном университете. Научный консультант доктор биологических наук, профессор Щеглов Дмитрий Иванович Официальные оппоненты: доктор биологических наук, Кислых Евгений Евгеньевич доктор биологических наук,...»

«ВАГАЙЦЕВА КСЕНИЯ ВАЛЕРЬЕВНА ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ ПОПУЛЯЦИЙ СЕВЕРНОЙ ЕВРАЗИИ ПО STR И SNP МАРКЕРАМ X-ХРОМОСОМЫ И ИХ ДНКИДЕНТИФИКАЦИОННЫЙ ПОТЕНЦИАЛ 03.02.07 генетика АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук Томск – 2015 Работа выполнена в Федеральном государственном бюджетном научном учреждении «Научно-исследовательский институт медицинской генетики», г. Томск Научный руководитель: доктор биологических наук, профессор Степанов Вадим...»

«КИРИЛЛОВА Ольга Сергеевна АГАРИКОИДНЫЕ БАЗИДИОМИЦЕТЫ НАЦИОНАЛЬНОГО ПАРКА «РУССКИЙ СЕВЕР» (ВОЛОГОДСКАЯ ОБЛАСТЬ) Специальность 03.00.24 – микология Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук Москва Работа выполнена на кафедре микологии и альгологии Биологического факультета Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова Научный руководитель...»

«ДОРОНИН Максим Игоревич ЭКСПРЕСС-МЕТОДЫ ВЫЯВЛЕНИЯ ВИРУСА ИНФЕКЦИОННОГО НЕКРОЗА ГЕМОПОЭТИЧЕСКОЙ ТКАНИ ЛОСОСЕВЫХ РЫБ 03.02.02 «Вирусология» Aвтореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук Владимир – 2015 Работа выполнена в федеральном государственном бюджетном учреждении «Федеральный центр охраны здоровья животных» (ФГБУ «ВНИИЗЖ»). доктор биологических наук Научный руководитель: Мудрак Наталья Станиславовна Грищенко Леонид Иванович – Официальные...»

«Олейникова Елена Михайловна СТЕРЖНЕКОРНЕВЫЕ ТРАВЫ ЮГО-ВОСТОКА СРЕДНЕЙ РОССИИ Специальность 03.02.01 – ботаника АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени доктора биологических наук Воронеж – 2015 Работа выполнена на кафедре биологии и защиты растений ФГБОУ ВПО «Воронежский государственный аграрный университет имени императора Петра I» Османова Гюльнара Орудж кзы, доктор биоОфициальные оппоненты: логических наук, доцент, ФГБОУ ВПО «Марийский государственный...»

«Калинкин Дмитрий Евгеньевич ФАКТОРЫ ФОРМИРОВАНИЯ ЗДОРОВЬЯ НАСЕЛЕНИЯ ГОРОДОВ В ЗОНЕ ВОЗДЕЙСТВИЯ ПРЕДПРИЯТИЙ АТОМНОЙ ИНДУСТРИИ 14.02.03 – общественное здоровье и здравоохранение Автореферат диссертации на соискание учёной степени доктора медицинских наук Томск – 2015 Работа выполнена в Федеральном государственном унитарном предприятии «Северский биофизический научный центр» Федерального медикобиологического агентства Российской Федерации (г. Северск) Научный консультант: доктор...»

«УДК 639.2.055: 639.2.053.7 БУЛГАКОВА Татьяна Ивановна РЕГУЛИРОВАНИЕ МНОГОВИДОВОГО РЫБОЛОВСТВА НА ОСНОВЕ МАТЕМАТИЧЕСКОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ Специальность– 05.18.17 –промышленное рыболовство АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени доктора технических наук Москва – 2009 г. Работа выполнена в лаборатории Системного анализа промысловых биоресурсов Всероссийского научно-исследовательского института рыбного хозяйства и океанографии (ФГУП ВНИРО) Официальные оппоненты: доктор...»

«Степина Елена Владимировна ЭКОЛОГО-ФЛОРИСТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА СТЕПНОЙ РАСТИТЕЛЬНОСТИ ЮГО-ЗАПАДНЫХ РАЙОНОВ САРАТОВСКОЙ ОБЛАСТИ 03.02.08 – экология (биологические науки) Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук Саратов – 2015 Работа выполнена в Балашовском институте (филиале) федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего профессионального образования «Саратовский государственный университет имени Н.Г....»

«Гузеева Елена Александровна МОЛЕКУЛЯРНАЯ ТАКСОНОМИЯ И МОРФОЛОГИЯ НЕМАТОД НАДСЕМЕЙСТВА THELASTOMATOIDEA, ОБИТАЮЩИХ В НАЗЕМНЫХ ЧЛЕНИСТОНОГИХ 03.02.04 – зоология 03.02.11 – паразитология АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук МОСКВА 2010 Работа выполнена в лаборатории фауны и систематики паразитов Центра паразитологии Института проблем экологии и эволюции имени А.Н. Северцова РАН и на кафедре зоологии беспозвоночных Биологического...»

«БОЛГОВА Светлана Борисовна РЫБНЫЕ КОЛЛАГЕНЫ: ПОЛУЧЕНИЕ, СВОЙСТВА И ПРИМЕНЕНИЕ 05.18.07 – Биотехнология пищевых продуктов и биологических активных веществ Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата технических наук Воронеж – 2015 Работа выполнена в Федеральном государственном бюджетном образовательном учреждении высшего образования «Воронежский государственный университет инженерных технологий». Научный руководитель: Заслуженный деятель науки РФ, доктор...»

«Якимова Татьяна Николаевна Эпидемиологический надзор за дифтерией в России в период регистрации единичных случаев заболевания 14.02.02 эпидемиология Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата медицинских наук Москва 2015 Работа выполнена в Федеральном бюджетном учреждении науки «Московский научно исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н. Габричевского» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия...»

«Скородумова Любовь Олеговна АНАЛИЗ СТАТУСА ЭКСПРЕССИИ РАКОВО-ТЕСТИКУЛЯРНЫХ ГЕНОВ КАК МИШЕНЕЙ ДЛЯ ТЕРАПИИ И ПРОФИЛАКТИКИ ОНКОЛОГИЧЕСКИХ ЗАБОЛЕВАНИЙ Специальность 03.01.03 – молекулярная биология АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук МОСКВА Работа выполнена в лаборатории генной терапии Федерального государственного бюджетного учреждения науки Института биологии гена Российской академии наук Научный Ларин Сергей Сергеевич, кандидат...»

«Вайсвалавичене Валентина Юрьевна СТРУКТУРА СРЕДСТВ, МЕТОДОВ И УСЛОВИЙ РАЗВИТИЯ ДВИГАТЕЛЬНЫХ СПОСОБНОСТЕЙ У ДЕТЕЙ СТАРШЕГО ДОШКОЛЬНОГО ВОЗРАСТА 5-7 ЛЕТ 13.00.04 – теория и методика физического воспитания, спортивной тренировки, оздоровительной и адаптивной физической культуры АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата педагогических наук Москва – 2015 Диссертационная работа выполнена на кафедре теории и методики базовых видов физического воспитания...»

«РЕГУЗОВА Ална Юрьевна Исследование специфической активности полиэпитопных Т-клеточных ВИЧ-1 иммуногенов, полученных с использованием различных стратегий проектирования 03.01.03 – молекулярная биология АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук Кольцово – 2015 Работа выполнена в Федеральном бюджетном учреждении науки «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор». Карпенко Лариса Ивановна, доктор биологических Научные...»

«Потапов Григорий Сергеевич СТРУКТУРА НАСЕЛЕНИЯ ШМЕЛЕЙ (HYMENOPTERA: APIDAE, BOMBUS LATR.) ЕВРОПЕЙСКОГО СЕВЕРА РОССИИ 03.02.08 – Экология (биология) АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук Томск – 2015 Работа выполнена в Федеральном государственном бюджетном учреждении науки Институте экологических проблем Севера Уральского отделения Российской академии наук, в лаборатории экологии популяций и сообществ. Научный руководитель: доктор...»

«СЕЛИФОНОВА Жанна Павловна СТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ ЭКОСИСТЕМ ЗАЛИВОВ И БУХТ ЧЕРНОГО И АЗОВСКОГО МОРЕЙ (РОССИЙСКИЙ СЕКТОР) Специальность 25.00.28 – Океанология Д 002.140.01 Диссертация на соискание ученой степени доктора биологических наук Мурманск, 2015 Работа выполнена в ФГБУН Мурманском морском биологическом институте КНЦ РАН и ФГБОУ...»

«НИКУЛИНА Неля Шамилевна ПРОДУКТИВНЫЕ КАЧЕСТВА И БИОЛОГИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ КОРОВ ЧЕРНО-ПЕСТРОЙ ПОРОДЫ ПРИ ИСПОЛЬЗОВАНИИ ПРОБИОТИЧЕСКОЙ ДОБАВКИ «БИОГУМИТЕЛЬ-Г» 06.02.10 – частная зоотехния, технология производства продуктов животноводства АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук Уфа – 2015 Работа выполнена в Федеральном государственном бюджетном образовательном учреждении высшего образования «Башкирский государственный аграрный...»







 
2016 www.konf.x-pdf.ru - «Бесплатная электронная библиотека - Авторефераты, диссертации, конференции»

Материалы этого сайта размещены для ознакомления, все права принадлежат их авторам.
Если Вы не согласны с тем, что Ваш материал размещён на этом сайте, пожалуйста, напишите нам, мы в течении 1-2 рабочих дней удалим его.